Στις 24 Δεκεμβρίου 2002, ο Scott Peterson ανέφερε στην αστυνομία ότι το δικό του Η οκτώ μηνών έγκυος σύζυγος Laci Peterson, έλειπε. Ανέφερε ότι την είχε δει τελευταία φορά γύρω στις 9:30 το πρωί πριν πάει για ψάρεμα. Ο Scott άφησε ένα μήνυμα για τη Laci γύρω στις 2:30 μ.μ. Όταν επέστρεψε στο σπίτι, βρήκε τη σκυλίτσα τους, τη ΜακΚένζι, στην πίσω αυλή με το λουρί του ακόμα, το αυτοκίνητο της Λάτσι στο δρόμο και τα υπάρχοντά της μέσα στο σπίτι. Ενημέρωσε την αστυνομία ότι η Λάτσι είχε σχεδιάσει να βγάλει τον σκύλο βόλτα και ένας γείτονας κατέθεσε ότι είδε τον σκύλο στο δρόμο με το λουρί του αλλά χωρίς τη Λάτσι. Η υπόθεση ήταν τόσο ανησυχητική όσο και ανησυχητική και το «American Murder: Laci Peterson» του Netflix εμβαθύνει στα στοιχεία και την υπόθεση που χτίστηκε εναντίον του Scott Peterson για τη δολοφονία της συζύγου και του αγέννητου παιδιού του.
Η υπόθεση της εισαγγελίας εναντίον του Scott Peterson βασίστηκε κυρίως σε έμμεσες αποδείξεις, καθώς δεν διέθετε άμεσα φυσικά στοιχεία. Αυτά περιελάμβαναν τη φερόμενη απορριπτική συμπεριφορά του Σκοτ κατά τη διάρκεια της έρευνας και ισχυρισμούς από ντετέκτιβ ότι ήταν απρόθυμος να επιτρέψει έρευνες στο σκάφος και στο σπίτι του. Του σχέση με την Amber Frey, που είχε αποκαλύψει στην αστυνομία στις 24 Ιανουαρίου 2003, ήταν ένα σημαντικό κόκκινο πανί στην υπόθεση. Επιπλέον, οι αρχές πίστευαν ότι το γεγονός ότι πούλησε το αυτοκίνητο του Laci και σχεδίαζε να πουλήσει το σπίτι τους ήταν επίσης ένδειξη της ενοχής του.
Στις 18 Απριλίου 2003, η ανάλυση DNA επιβεβαίωσε ότι τα σώματα μιας ενήλικης γυναίκας και ενός τελειόμηνου αρσενικού εμβρύου που ανασύρθηκαν από την ακτή του Κόλπου του Σαν Φρανσίσκο στο Richmond's Point Isabel Regional Shoreline Park στις 13 Απριλίου ήταν αυτά της Laci και του παιδιού της, Conner. . Ο Σκοτ συνελήφθη στο Σαν Ντιέγκο κοντά σε ένα γήπεδο γκολφ La Jolla με 15.000 δολάρια σε μετρητά, προμήθειες για κάμπινγκ, ρούχα, πολλές πιστωτικές κάρτες και την ταυτότητα του αδελφού του. Είχε επίσης βάψει τα μαλλιά του ξανθά και είχε μεγαλώσει ένα τράγο, κάνοντάς τον να μοιάζει με τον αδερφό του. Οι ντετέκτιβ ισχυρίστηκαν ότι ο Σκοτ σχεδίαζε να φύγει στο Μεξικό, αλλά ο Σκοτ και η οικογένειά του επέμεναν ότι έμενε έξω από το αυτοκίνητό του για να αποφύγει την προσοχή των μέσων ενημέρωσης και έφερε την ταυτότητα του αδερφού του για να αποκτήσει πρόσβαση σε ένα κλαμπ του γκολφ.
Ο Scott Peterson συνελήφθη την ίδια μέρα με την κατηγορία δύο κακουργημάτων για φόνο με πρόθεση και ειδικές συνθήκες. Μεταφέρθηκε πίσω στη γενέτειρά του και κρατήθηκε στη φυλακή της κομητείας Modesto. Στις 21 Απριλίου, οδηγήθηκε στο Ανώτατο Δικαστήριο της Κομητείας Stanislaus, όπου δήλωσε αθώος για τις κατηγορίες. Λόγω της έντονης προσοχής των μέσων ενημέρωσης γύρω από την υπόθεση, η δίκη του μεταφέρθηκε στην κομητεία San Mateo, ξεκινώντας την 1η Ιουνίου 2004. Η Amber Frey κατέθεσε εναντίον του και με τα στοιχεία που παρουσιάστηκαν, ο Scott κρίθηκε ένοχος στις 12 Νοεμβρίου 2004, για πρώτη -δολοφονία βαθμού με ειδικές συνθήκες για τον θάνατο του Λάτσι και δολοφονία δεύτερου βαθμού του Κόνερ.
Στις 13 Δεκεμβρίου, το δικαστήριο πρότεινε θανατική ποινή για τον Σκοτ, την οποία επιβεβαίωσε ο δικαστής στις 16 Μαρτίου, καταδικάζοντάς τον σε θάνατο με θανατηφόρα ένεση και διατάσσοντάς τον να πληρώσει 10.000 δολάρια για την κηδεία της εκλιπούσας συζύγου του. Στη συνέχεια, φυλακίστηκε στην κρατική φυλακή του Σαν Κουέντιν, τη μοναδική θανατοποινία της Καλιφόρνια. Ένας εκπρόσωπος της φυλακής ενημέρωσε το περιοδικό People ότι ο Scott είχε γίνει αρκετά δημοφιλής, κερδίζοντας το παρατσούκλι 'Scottie-Too-Hottie' και ότι άρεσε στις γυναίκες φρουρούς ενώ λάμβανε γράμματα από ανθρώπους σε όλη τη χώρα. Το 2012, η δημοσιογράφος Nancy Mullane παρατήρησε τον Scott στη φυλακή και παρατήρησε ότι δεν φαινόταν «καταθλιπτικός» αλλά φαινόταν «υγιής».
Τον Δεκέμβριο του 2003, η μητέρα της Laci Peterson υπέβαλε μήνυση 5 εκατομμυρίων δολαρίων κατά του Scott Peterson για τον θάνατο της Laci και του αγέννητου παιδιού της, ξεκινώντας τόσο μια παράνομη δράση θανάτου όσο και μια δράση επιβίωσης. Μέχρι τον Οκτώβριο του 2005, τα έσοδα από το ασφαλιστήριο συμβόλαιο ζωής της Laci, ύψους 250.000 δολαρίων, απονεμήθηκαν στη μητέρα της και τον Απρίλιο του 2009, η αγωγή για παράνομο θάνατο αποσύρθηκε. Ο Scott παρέμεινε στην κρατική φυλακή του San Quentin και υπέβαλε απευθείας έφεση κατά της θανατικής του ποινής στο Ανώτατο Δικαστήριο της Καλιφόρνια τον Ιούλιο του 2012. Τον Νοέμβριο του 2015, ο Scott Peterson υπέβαλε αίτηση habeas corpus για να εισαγάγει νέα στοιχεία στην υπόθεσή του. Υποστήριξε ότι αρκετοί γείτονες είχαν καταθέσει ότι είδαν τη Λάτσι ζωντανή αφού είχε φύγει από το σπίτι την ημέρα της εξαφάνισής της.
Η αναφορά ισχυριζόταν επίσης για ανάρμοστη συμπεριφορά των ενόρκων, υποστηρίζοντας ότι ένας από τους ενόρκους είχε πει ψέματα για το ιστορικό της με την ενδοοικογενειακή βία, καθιστώντας την ακατάλληλη για τη δίκη. Το δικαστήριο άκουσε τα επιχειρήματα της άμεσης προσφυγής του τον Ιούνιο του 2020, κατά την οποία η υπεράσπιση του Scott υποστήριξε ότι ένας υποψήφιος ένορκος είχε απολυθεί εσφαλμένα και ότι είχαν γίνει πολλαπλά λάθη κατά τη διάρκεια της δίκης. Στις 24 Αυγούστου 2020, το δικαστήριο ανέτρεψε την θανατική του ποινή.
Αφού οι εισαγγελείς αποφάσισαν να μην επαναλάβουν τη φάση της ποινής, στις 8 Δεκεμβρίου 2021, το Ανώτατο Δικαστήριο της Καλιφόρνια καταδίκασε εκ νέου τον Σκοτ σε ισόβια κάθειρξη χωρίς τη δυνατότητα αποφυλάκισης για τη δολοφονία πρώτου βαθμού της Λάτσι και 15 χρόνια έως ισόβια για τον δεύτερο βαθμού δολοφονία του αγέννητου παιδιού τους. Ο ισχυρισμός για παράπτωμα του ενόρκου δεν έγινε δεκτός στο δικαστήριο. Στις 20 Δεκεμβρίου 2022, η έφεσή του για το habeas corpus απορρίφθηκε επίσης.
Τον Ιανουάριο του 2024, το The Los Angeles Innocence Project ανακοίνωσε ότι είχε ασχοληθεί με την υπόθεση του Scott Peterson και κατέθεσε νέες προτάσεις ζητώντας επιπλέον ακροάσεις για την αποδοχή νέων αποδεικτικών στοιχείων και τη διεξαγωγή τεστ DNA. Μεταξύ των αιτημάτων, το δικαστήριο ενέκρινε μόνο τη δοκιμή ενός κομματιού κολλητικής ταινίας 15,5 ιντσών που βρέθηκε στο παντελόνι της Laci κατά τη διάρκεια της αυτοψίας της. Άλλα αιτήματα της υπεράσπισης, όπως η εξέταση DNA σε ένα αιματοβαμμένο στρώμα που βρέθηκε σε ένα καμένο βαν κοντά στο σπίτι του Σκοτ και της Λάτσι, απορρίφθηκαν.
Η εισαγγελία αντιτάχθηκε στην ώθηση για νέα εξέταση DNA, υποστηρίζοντας ότι παρόμοια τεστ είχαν ήδη διεξαχθεί το 2013 και το 2019 και δεν είχαν αθωώσει τον Σκοτ εκείνη την εποχή. Παρά τις αντιρρήσεις της εισαγγελίας, το δικαστήριο ενέκρινε τη δοκιμή της κολλητικής ταινίας και τον Ιούλιο του 2024, πραγματοποιήθηκε ακρόαση για να προσδιοριστεί η υπηρεσία που θα διενεργούσε τις δοκιμές. Ο Scott, τώρα 51 ετών και ακόμα φυλακισμένος στην κρατική φυλακή Mule Creek στο Ione της Καλιφόρνια, παλεύει για την τελευταία του ευκαιρία σε μια νέα δίκη, αποφασισμένος να εξασφαλίσει την απελευθέρωσή του.